1943年10月,盖世太保发现了艾琳娜拯救犹太儿童的真相后,将她关进了帕维亚克监狱,并对她进行了严刑拷打,打残了她的双腿。艾琳娜咬紧牙关忍受着一切,自始至终没有吐露任何一个孩子的下落,没有出卖过任何一个同伴。纳粹最终判处她死刑。由于波兰地下抵抗组织给了盖世太保行刑刽子手一大笔钱,艾琳娜被放走,才侥幸逃过了一死。之后,她以假名继续在波兰生活。